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微生物组在人类健康和疾病中的作用日益受到关注，在近十年以来已经成为生命科学的热点和重点领域。对于人体微生物组例如肠道菌群的基础组成和功能的研究已经积累了大量的数据，但是影响微生物组的环境及宿主因素仍然有许多亟待解决的问题。人的基因组与代谢和免疫相关的基因和微生物组有着密切的互作，可能影响微生物的多样性；但是由于微生物组作为复杂生态系统，又有大量的随机因素干扰，因此研究人体影响宿主微生物组成的基因需...
科学家构建小麦基因定位与基因组研究平台（图）
中国农业科学院作物科学研究所 小麦基因资源 基因定位 基因组 分子植物
2020/12/20
近日，中国农业科学院作物科学研究所小麦基因资源发掘与利用创新团队牵头构建了小麦基因定位与基因组研究平台——WheatGmap（https://www.wheatgmap.org），为高效克隆小麦功能基因提供了一个有效的数据利用、分析和共享平台。相关研究成果在线发表于《分子植物（Molecular Plant）》。
“海稻86”耐盐相关基因定位取得进展（图）
海稻86 耐盐 基因定位
2020/3/26
版纳植物园热带稻种保护与遗传改良研究组的研究发现，在盐土环境条件下，耐盐种质“海稻86”苗期表现出比普通水稻品种更高的耐盐性，遗传分析结果显示耐盐对盐敏感为显性。进一步利用“海稻86”为供体亲本，云南粳型水稻品种“滇粳优1号”为受体亲本，构建了F2群体并进行BSA（分离群体分组分析法）测序分析，在1号染色体上确定了一个2.78 Mb的区域作为候选区域。为了进一步缩小候选区域范围，我们利用SSR分子...
植物重要性状相关的数量性状基因座（QTL）和基因定位一直是结构基因组学的研究重点，也是遗传机制解析和分子育种的重要基础。木本植物具有重要的经济、生态价值，但用于其研究的传统基因定位方法存在耗时长、工作量大、通量低、成本高且效果不佳等问题。近年来，由于测序技术发展日新月异，基于二代测序技术的集群分离分析法（NGS-based BSA）开始应用于木本植物中。与传统的集群分离分析法（BSA）技术相比，N...
水稻温度超敏突变体ths1的鉴定和基因定位
水稻 温度敏感 侧根 基因定位
2018/11/28
从籼稻品种‘Kasalath’甲基磺酸乙酯(ethyl methanesulfonate, EMS)诱变突变体库中筛选到一个温度敏感突变体ths1 (temperature hyper-sensitive 1)。与野生型相比, 突变体ths1的主根伸长和侧根发育对温度变化非常敏感: 在30°C条件下ths1表型与野生型一致; 在温度低于26°C时, ths1主根变短, 侧根缺失。在低温(24°C)...
贵州地方粳稻‘黎平杂边禾’矮秆小粒突变体dss1鉴定与基因定位
水稻 矮化小粒突变体dss1 基因定位 OsDWARF基因 油菜素内酯
2018/11/27
本研究从贵州地方粳稻(Oryza sativa ssp. japonica)品种‘黎平杂边禾’甲基磺酸乙酯(EMS)突变体库中筛选获得一份能稳定遗传的矮秆小粒突变体, 暂命名为dss1 (dwarf and small seed 1)。与野生型相比, dss1表现为植株矮化、株型直立、叶色深绿、籽粒变小、第二节间严重缩短、穗长增加等典型油菜素内酯(BR)缺陷突变体的性状。显微观察结果表明dss1叶...
拟南芥盐敏感突变体EMS85的快速基因定位与分析
拟南芥 盐敏感突变体 图位克隆 SOS2基因
2018/3/23
土壤盐碱化是造成农作物减产的主要原因.作者通过对拟南芥(Arabidopsis thaliana)野生型种子Col-0进行甲基磺酸乙酯(EMS)诱变,筛选到1株盐敏感突变体EMS85.通过杂交和后代性状分离比确定该突变体的不耐盐性是受隐性单基因控制.采用图位克隆的方法,通过对拟南芥5条染色体上的SSLP标记的筛选,挑选了24对均匀分布于染色体上的SSLP标记作为基因初定位,同时设计了一系列精细定位...
Mapping-by-sequencing在作物农艺性状相关基因定位的应用
Mapping-by-sequencing Bulked segregant analysis 基因定位 作物
2018/12/29
通过挖掘控制重要农艺性状的基因以提高农作物产量是育种学家一直关注的问题。然而由于农作物遗传背景复杂且基因组庞大, 该过程往往步骤繁琐, 耗时长且成本较高。Mapping-by-sequencing (利用高通量测序进行基因定位, MBS)利用二代测序技术和遗传分离群体混池建库分析的方法成功解决了上述问题, 加快了农作物重要农艺性状的基因定位同时也降低了研究成本。该方法已经成功应用于重要农艺性状相关...
南京师范大学生命科学学院遗传学课件第九章 基因定位
南京师范大学生命科学学院 遗传学 课件 第九章 基因定位
2015/7/7
南京师范大学生命科学学院遗传学课件第九章 基因定位。
近日，生物中心利用小麦分子遗传连锁图谱对不同水分条件下小麦水、旱交重组自交系（RIL）群体的碳同位素分辨率（∆）进行数量性状基因位点（QTL）定位，在四种水分条件下检测到5个控制小麦∆的QTL，分别位于小麦5B、7B 和3D染色体上，5个QTL 对∆表型贡献率为8.2%-40.3%。在三种水分条件下检测到相同的稳定表达的QTL,均位于小麦7B 染色体上，其中 位...
水稻条纹窄叶突变体nsl1的形态和生理分析及基因定位
水稻 条纹 窄叶 基因定位
2014/6/12
水稻（Oryza sativa L.）叶形和叶色直接影响光能利用，最终影响其产量和品质，是水稻重要的农艺性状. 通过甲基磺酸乙酯诱变籼稻缙恢10号发现了1个遗传稳定的水稻条纹窄叶突变体，暂命名为nsl1. nsl1在苗期叶片呈浅白色，拔节期后出现平行于叶脉分布的白色条纹. 而且其叶片显著窄于野生型缙恢10号. nsl1突变体的白色条纹部位细胞内部叶绿体严重解体，叶绿素含量显著下降. 荧光参数F0，...
在籼稻品种R401辐射诱变的M2群体中筛选到一个苗期耐盐突变体, 在150 mmol/L的NaCl溶液处理下对照植株枯萎死亡, 而突变体植株依然存活。以粳稻品种Nipponbare(不耐盐)和耐盐突变体作亲本, 构建了一个F2群体, 调查该群体在150 mmol/L的NaCl溶液胁迫下的表现, 发现Nipponbare和耐盐突变体苗期耐盐性的差异受单个主基因控制, 耐盐为隐性, 将该基因暂时命名为...
一个水稻矮秆突变体的遗传分析及基因定位
秆突变体 基因定位 遗传分析 水稻
2011/12/19
水稻(Oryza sativa)是我国重要的粮食作物之一。水稻矮秆材料的引入掀起了第1次“绿色革命”。但近年来, 在水稻育种中矮生基因遗传单一的问题越来越突出, 已经严重影响到水稻产量的持续提高。利用60Co-γ射线辐照籼稻亲本材料M804获得了一个性状能够稳定遗传的矮秆突变体MU101。对该矮秆突变体和台粳16号杂交获得的F2代的遗传分析表明, 该矮秆性状受1对隐性单基因控制, 并暂命名为ds1...
水稻短根毛突变体Ossrh2的表型分析与基因定位
基因定位 遗传分析 水稻 短根毛突变体
2011/12/19
在粳稻品种中花11为遗传背景的T-DNA突变体库中筛选获得一个遗传稳定的水稻(Oryza sativa)短根毛突变体Ossrh2(Oryza sativa short root hair 2)。突变体在苗期表现为根毛数量减少, 为野生型的61.4%, 根毛长度明显变短, 只有野生型的22.8%, 同时根毛增粗, 根毛形态也发生了变异, 局部扭曲膨胀和分叉, 除此之外突变体的地上部和根部生长情况与野...