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上海药物所开展卤键对蛋白质结构稳定性及其与多肽结合影响的计算研究(图)
蛋白质结构 多肽结合 量子化学
2024/4/14
2024年3月19日,中国科学院上海药物研究所朱维良/徐志建团队基于数据库统计分析,并结合量子化学计算和分子动力学模拟对蛋白/多肽中的卤键进行了研究,发现在蛋白-多肽相互作用界面的卤键可以增强它们的结合亲和力,蛋白内部形成的分子内卤键有助于提高蛋白质的结构稳定性,而对于不能形成分子内卤键的蛋白质则会导致其结构稳定性降低。该研究成果以题为“Impact of Halogen Bonds on Pro...
2023年4月3日,精密测量院李从刚研究团队,以高灵敏的19F化学标记方法,结合电穿孔递送技术,实现了人源细胞内6-40 kD的结构蛋白观测,其检测浓度低至1.0 μM,接近了部分蛋白质的生理浓度。相关研究成果发表于《德国应用化学》(Angew. Chem. Int. Ed.)。
科技日报北京2022年1月17日电 (记者张梦然)美国罗格斯大学领导的团队在探究生物学中最深刻的未解问题之一时,发现了可能导致古代地球原始汤中生命起源的蛋白质结构。该研究近日发表在《科学进展》杂志上。
从预测进化 AI能“构想”新蛋白质结构
AI 新蛋白质 结构
2021/12/9
半个世纪以来,科学家一直在寻找解决“蛋白质折叠问题”的方法。这是生物学领域的一项重大挑战,难倒了几代科学家。但现在,人工智能(AI)解决了这一问题。据《自然》杂志1日发表的论文,包括美国华盛顿大学、伦斯勒理工学院和哈佛大学的研究人员在内的研究小组描述了一种升级的阿尔法折叠系统,该系统由深度思维(DeepMind)公司开发,会“构想”出具有稳定结构的新蛋白质。
继去年在第14届“蛋白质结构预测关键评估大赛(CASP14)”中揭晓了其新开发的人工智能模型AlphaFold,并承诺会分享该方法,为科学共同体提供广泛、免费的获取途径之后,位于英国伦敦、由人工智能程序师兼神经科学家Demis Hassabis等人联合创立的人工智能前沿企业——DeepMind公司的研究人员近日在《自然》上发表论文,将AlphaFold2开源。AlphaFold2能以就计算机方法而...
一项革命性的蛋白质三维形状测定技术正在蓬勃发展。上周,一个收集由冷冻电子显微镜(cryo-EM)测定的蛋白质和其他分子结构的数据库,获得了第10000个数据条目。据《自然》报道,近年来,各实验室向电子显微镜数据库(EMDB,由欧洲生物信息研究所建立,旨在满足学术界对于冷冻电镜数据的需求)提交的数据呈指数级增长,这主要因为全世界实验室cryo-EM数量的爆发式增长。尽管数据库也接收其他电子显微镜结构...
济南大学生命科学学院生物化学课件第6章蛋白质结构与功能的关系。
2018年4月17日下午,中科院武汉物理与数学研究所唐淳研究员做客我校理学院迎双甲子校庆系列学术活动,以“蛋白质结构动态可视化”为题作学术报告。我校理学院、信息学院、植物科学技术学院的部分师生参加了此次活动。在本次报告中,唐淳首先简单地介绍了蛋白质的一、二、三、四级结构,通过生动有趣的图像解释了蛋白质的结构是动态变化的:化学键振转、侧链运动、局部运动、结构域运动、蛋白质互作及蛋白质机器运作。随后,...
为分析并预测斯氏副柔线虫免疫相关基因CTPK编码蛋白结构、功能以及其作为疫苗候选抗原的可能性,通过提取斯氏副柔线虫组织RNA,反转录合成cDNA,设计特异性引物以扩增CTPK基因的CDS区,并利用生物信息学软件对CTPK进行蛋白质结构分析和抗原表位预测。生物信息学分析表明,CTPK基因cDNA序列全长共519 bp,具有完整的开放阅读框(519 bp),编码173个氨基酸,相对分子质量和等电点大小...
齐鲁医药学院生物化学课件第01章 蛋白质结构与功能。
西北大学生物化学课件第六章 蛋白质结构与功能的关系
西北大学 生物化学 课件 第六章 蛋白质结构与功能的关系
2017/4/10
西北大学生物化学课件第六章 蛋白质结构与功能的关系。
近日,中国科学院武汉物理与数学研究所李从刚研究组在限域条件下蛋白质结构与功能研究方面获得重要进展,相关研究结果发表在《德国应用化学》杂志上(Angew. Chem. Int. Ed)。限域环境在细胞中普遍存在,比如分子伴侣蛋白GroEL,核糖体的肽链通道等分子机器,以及多种细胞器中的膜间隙等。已有研究表明限域环境对蛋白质的折叠、稳定性等均有影响,但限域对多结构域蛋白的结构与功能的影响知之甚少。