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单细胞多组学技术已成为生命科学的有力工具，但一个精准、低损伤、广谱适用、简捷的目标表型单细胞获取手段，是靶向性单细胞基因组、转录组、蛋白质组或代谢物组分析的先决条件。近日，青岛能源所单细胞中心发明了光镊辅助静态池成像分选技术（OPSI），能“所见即所得”、保持细胞原位活性、高通量地分选明场、荧光、拉曼成像下的目标单细胞，支撑高质量的单细胞基因组/转录组测序。该技术对于细菌、古菌、真菌、动植物、人体...
单细胞转录组测序（scRNA-seq）能够从单个细胞水平对转录组进行研究，可以最大程度反映细胞间的异质性，并为鉴定新的细胞亚群和阐明细胞状态转换的调控机制提供技术支持。近年来，10X Genomics、Smart-seq2、Fluidigm C1等技术平台的出现，极大地推动了单细胞测序的发展，使其广泛地应用于基础科研与临床研究中。然而，由于单个细胞的mRNA表达量较低以及测序技术的噪声原因，使得单...
2022年7月24日，上海交通大学基础医学院组织胚胎学与遗传发育学系李令杰课题组在国际学术期刊Briefings in Bioinformatics在线发表题为 “FitDevo: accurate inference of single-cell developmental potential using sample-specific gene weight” 的研究论文，研究中开发了一款用于...
科学家研究实现单细胞转录组的空间映射
单细胞RNA测序 单细胞转录组学 细胞跋涉 空间映射
2022/4/22
单细胞RNA测序方法可以剖析单细胞的转录组表达，但不能保存空间信息。相反，空间转录组学可以检测剖析组织切片中的空间区域，但不具备单细胞分辨率。美国德克萨斯大学研究团队提出一种计算方法，揭示组织中单细胞转录组的空间结果。该研究近日发表在《Nature Biotechnology》上，题为：Spatial charting of single-cell transcriptomes in tissue...
细胞命运或状态由多维度染色质修饰景图及其调控基因表达谱决定。虽然各类组蛋白修饰、转录因子结合等表观因子调控的机制与结果各异，却协同决定了基因的选择性表达。全局性的研究多维度的表观因子相互作用有助于理解生命发育基因表达调控的机制和细胞命运的决定，以及疾病发生过程基因表达异常的原因，为疾病的治疗提供理论基础。虽然目前已有多种能在单细胞水平上高精度解析单一表观修饰的实验方法，但是用现有技术获得的数据很难...
新型冠状病毒肺炎（COVID-19）爆发以来，全球感染人数已超过一亿人，死亡病例已超过两百万人，给全球社会经济带来了极大灾难。认识和理解新冠肺炎发病机理对于诊疗与防控具有重要意义。单细胞转录组测序技术在生命科学各个领域的广泛应用催生了许多重要的生物学发现，然而，该技术在新冠肺炎研究中的应用因其成本高、样本量小，存在统计效力不足、结论可靠性疑问等问题。
2009年首个单细胞转录组测序技术问世，开启了单细胞组学时代（scRNA-seq）（Tang et al., 2009）。过去十余年间单细胞测序技术的不断发展极大地加速了生物医学领域的相关研究，帮助科研人员克服了稀有生物样本以及生物样本内生异质性等重大挑战，一系列模式生物及人类自身的单细胞转录组图谱也由此诞生。然而目前的单细胞测序技术几乎全都是基于二代测序平台，测序读长短，一般在150bp左右，即...
清华大学医学院纪家葵课题组发表体外成熟人卵单细胞多组学研究及总结干细胞分化为配子进展文章（图）
清华大学医学院 纪家葵 体外成熟 人卵单细胞 多组学研究 干细胞分化 配子 进展文章
2020/10/23
清华大学医学院纪家葵课题组近期在生殖医学顶级期刊《Human Reproduction》 及《Human Reproduction Update》分别发表体外成熟人卵单细胞多组学研究(“Single-cell multiomic analysis of in vivo and in vitro matured human oocytes”) 及干细胞分化为配子近20年进展综述 (“Studying...
在全国人民关注的抗新冠病毒疫情过程中，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）也积极投入抗疫工作，发挥自己的特长、用最新的技术努力寻找治疗手段、改进诊断方法，在北京市科委的协调下联合首都医科大学附属北京佑安医院、北京义翘神州科技有限公司等单位为抗击新冠病毒贡献力量。
北京大学分子医学研究所何爱彬研究组开发新一代单细胞itChIP技术解析早期胚胎细胞命运决定机制（图）
北京大学分子医学研究所 何爱彬 新一代 单细胞itChIP技术 早期胚胎细胞 命运决定机制
2019/9/6
2019年9月3日，北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬组在Nature Cell Biology在线发表了题为“Profiling chromatin state by single-cell itChIP-seq”的文章，报道了利用一种全新的普适性，易操作的单细胞ChIP-seq技术解析早期胚层和器官发育中细胞命运的选择决定机制，并将这一方法命名为itChIP（simult...
北京大学何爱彬研究组开发高通量单细胞ChIP-seq技术——CoBATCH并解析多器官内皮细胞谱系发育的表观与功能异质性（图）
北京大学 何爱彬 高通量 单细胞ChIP-seq技术 多器官 内皮细胞谱系发育
2019/8/30
2019年8月27日，北京大学分子医学研究所，北京大学-清华大学生命科学联合中心研究员何爱彬研究组在Molecular Cell杂志在线发表题为“CoBATCH for high-throughput single-cell epigenomic profiling”的文章，报道了一种新的具有普适性、易操作、高通量和高质量的单细胞ChIP-seq技术，并将其命名为CoBATCH（combinato...
2019年6月21日，北京大学分子医学研究所、北京大学-清华大学生命科学联合中心研究员何爱彬研究组在Circulation Research杂志在线发表题为“Single-cell transcriptomics reveals chemotaxis mediated intra-organ crosstalk during cardiogenesis”的研究成果。先天性心脏病心脏结构发育畸形主要...
科学家解析了单细胞分辨率下的骨髓微环境
科学家 单细胞 分辨率 骨髓微环境
2019/5/13
近日，纽约大学医学院等科研人员在Nature上发表了题为“The bone marrow microenvironment at single-cell resolution”的文章，解析了单细胞分辨率下的骨髓微环境。机体的正常造血依赖造血细胞和支持造血细胞产生发育的骨髓微环境的相互作用，但是骨髓微环境分子复杂性和对应激的反应机制尚不完全清楚。在本研究中，科研人员在单细胞分辨率下，解析了小鼠骨髓血...
四川大学华西第二医院郭帆研究员团队在Cell Research上发文建立小鼠卵单细胞多组学图谱（图）
四川大学华西第二医院 郭帆 Cell Research 小鼠卵 单细胞 多组学图谱
2019/1/19
近日，四川大学华西第二医院郭帆课题组在学术期刊Cell Research（IF：15.4）上在线发表了题为“IntegrativeSingle-cell Analysis of Transcriptome, DNA Methylome and ChromatinAccessibility in Mouse Oocytes”的最新研究成果。四川大学华西第二医院古婵博士为该论文的第一作者，实验助理吴啟...
