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鸡mtDNA D-loop区单倍型簇频率与中国家鸡多母系起源研究
家鸡 mtDNA D-loop区 单倍型 聚类分析 频率 起源
2016/12/26
本研究旨在通过分析家鸡和原鸡D-loop区单倍型簇的区域性分布和频率揭示中国家鸡多母系起源的区域和传播途径。通过对1 347条鸡D-loop序列进行完全对比排序，共发现198种单倍型，聚成12个单倍型簇。分析结果显示，海岛型红色原鸡与家鸡和大陆型红色原鸡有明显差异；苏门答腊大陆型红色原鸡作为独立分支，也体现出与东南亚大陆型红色原鸡的区别。单倍型簇频率分析显示，Clade C代表的母系可能更早在东南...
Mitochondrial D-loop sequence variation among Hucul horse
genetic diversity horse mitochondrial DNA phylogeny
2015/6/24
Genetic variation in the Czech Hucul horse population was analyzed using a sequence analysis of the D-loop region of mitochondrial DNA. One hundred and sixty-five Hucul horses were tested. Sequencing ...
为研究安徽江淮水牛群体的分子种质特性，本试验测定了江淮水牛2个亚群共82个个体的线粒体Dloop区和细胞色素b基因完整序列，分析了序列遗传多态性及系统进化关系，并结合GenBank中已发表的141条中国水牛Dloop序列，进行了联合分析。结果在Dloop区内共发现核苷酸多态位点91个，组成104个单倍型，其中32个是在江淮水牛中新发现的单倍型。总体mtDNA Dloop区核苷酸多样性为(0...
家鸭、媒鸭和野鸭mtDNA D-loop区的遗传变异
鸭 D-loop 遗传多样性 系统进化
2013/12/3
旨在从mtDNA水平探讨我国家鸭的遗传多样性及家鸭与野鸭间的亲缘关系。运用DNA测序方法，测定了不同地域、水域和表型性状的9种家鸭（北京鸭、高邮鸭、巢湖鸭、绍兴鸭、连城白鸭、吉安红毛鸭、文登黑鸭、云南麻鸭、建昌鸭）80个个体、4 种媒鸭（西湖野鸭、钱江野鸭、枞阳媒鸭、媒头鸭）26个个体和斑嘴鸭8个个体，共计114个个体的mtDNA Dloop区 667 bp序列。9种家鸭单倍型多样度和核苷酸多样...
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析
云南文山 黄牛 mtDNA D-loop区 遗传多样性
2009/10/21
云南文山黄牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析。
山羊线粒体DNA D-loop区部分序列变异位点分析
山羊 线粒体DNA D-loop 变异
2008/12/1
截取了山羊线粒体DNA D-loop高变区453 bp的部分片段（线粒体全序列的15 735~16 187 bp处），共计1 182条序列进行了多重比对，并进行系统建树和网络关系分析，结果这些序列明显的分成了4个支系（A、 B、 C、 D），分别含有1 001、134、24和13条序列，进一步比对分析，发现这4个支系有各自特有的碱基变异特点，A、B、C和D分别有5、6、18和7个特有的碱基变异位点...
中国7个绵羊品种mtDNA D-loop区序列的系统发育与起源研究
绵羊 线粒体DNA 控制区 起源
2008/8/21
为探讨中国绵羊的起源、进化及遗传多样性，对新疆、内蒙古、西藏、云南、宁夏、山东等地区7个地方绵羊品种和1个外来品种共59个体的线粒体D-loop全序列进行了测序分析。7个地方绵羊群体的单倍型多样度（Hd）和核苷酸多样度（π）分别平均为0.996 0和0.030 6，表明我国地方绵羊品种的控制区遗传变异丰富。系统发育和网络进化分析均将中国绵羊分为3个明显的支系，揭示中国绵羊存在3个独立的母系起源；并...
通过线粒体DNA控制区的结构和多态性来研究我国家鸭的遗传多态性与系统进化。利用DNA测序技术测定了我国9个家鸭品种106个个体线粒体DNA控制区多变序列。序列分析结果显示：A、C、T、G碱基的平均含量分别为25.6％、33.3％、15.2％和25.9％。检测到34个变异位点，约占分析位点总数的5.1％，有转换、颠换、插入/缺失4种类型的变异。确定了31种单倍型，其中单倍型A7为家鸭的主体单倍型，品...
中国家驴mtDNA D-loop遗传多样性与起源研究
中国家驴 mtDNA D-loop 遗传多样性 起源
2008/4/3
对我国12个家驴品种126个个体（包括引用26个个体）的mtDNA D-loop 区399 bp进行分析，共检测到36种单倍型37个多态位点，其单倍型多样度为0.466 7~0.977 8，核苷酸多样度为0.001 2~0.028 5，表明我国家驴的遗传多态性丰富。与3条努比亚野驴、3条索马里野驴和6条亚洲野驴的序列构建 NJ系统发育树，首次证明我国家驴的母系起源为非洲野驴中的索马里驴和努比亚驴，...
中国部分山羊品种线粒体DNA D－loop序列遗传多样性分析
山羊 线粒体DNA D-loop 遗传多样性
2008/4/3
分析了中国部分本地山羊品种（18个品种200个个体）以及在中国饲养的引入品种（4个品种25个个体）线粒体DNA控制区（D-loop）的全序列，结合已报道的世界其它地方的山羊（15个品种77个体）以及2只野山羊的线粒体DNA控制区（D- loop）全序列共304个个体，分析结果表明：山羊线粒体DNA控制区约为1 212bp，检测到228个变异位点，203种单倍型，单倍型多样度为0.9...
采用DNA测序技术分析了中国9个山羊品种（板角山羊、成都麻羊、贵州黑山羊、贵州白山羊、黔北麻羊、马头山羊、陕南白山羊、黄淮山羊和雷州山羊）共计128个个体的mtDNAD-loop全序列。结果表明：山羊mtDNAD-loop全序列长度为1212-1213bp，检测到102个变异位点，约占分析位点总数的8.42%，可变位点中转换占99个，颠换2个，1个转换/颠换共存；界定了92种单倍型，有78种为各品...
藏羚羊mtDNA D-Loop区遗传多样性研究
藏羚羊 线粒体D-loop区 单倍型 遗传多样性
2007/12/21
该研究采用非损伤性DNA基因分型技术，对可可西里地区10个藏羚羊（Pantholops hodgsonii）个体的mtDNA非编码区部分片段（444~446bp）进行了序列分析，结果显示A、T%含量（61.8%）明显高于G、C%含量（38.2%），共发现10种单倍型，包括48个多态位点，其中转换位点44个、颠换位点1个、插入位点1个、缺失位点2个。单倍型间平均遗传距离为0.031，单倍型多态性（h...
摘要对贵州4个地方黄牛品种共计82个个体的线粒体DNA D-loop区全序列910 bp进行分析，检测到31种单倍型，其核苷酸多态位点65个，约占所测核苷酸总长的7.14%，其中有62个转换，2个颠换，1个转换/颠换共存。贵州4个黄牛品种mtDNA D-loop区核苷酸多样度（π值）为2.16%～2.61%，单倍型多样度（H）为0.695～0.909，表明贵州黄牛mtDNA遗传多样性比较丰富。根据...
