搜索结果: 1-9 共查到“观赏园艺学 SSR”相关记录9条 . 查询时间(0.031 秒)
以226个建兰品种为材料,应用16对SSR荧光引物进行扩增,基于等位基因最大法,按照93.36%、83.19%、71.68%、64.16%、54.42%、47.35%、32.30%、23.45%、17.26%、12.39%和8.41%等11个压缩比例逐步聚类,形成备选种质。结果表明,16对SSR荧光引物共检测到135个等位基因,平均观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样...
三色堇转录组SSR分析及分子标记开发
三色堇 EST-SSR 系统聚类
2019/6/5
为解决三色堇(Viola × wittrockiana)缺乏共显性DNA标记的问题,利用MISA软件对其转录组测序获得的167 576条unigene进行筛选,共检测出23 791个SSR位点,出现频率为14.20%,平均分布距离为6.75 kb。SSR位点中主导类型为三核苷酸重复,占总SSR的28.31%;其次是二核苷酸重复,占总SSR的12.86%。AG/CT与GAA/TTC分别是二核苷酸与三...
基于万寿菊转录组测序的SSR标记开发
万寿菊 SSR 转录组
2018/4/3
万寿菊(Tagetes erecta L.)花蕾转录组测序共获得48 953条Unigene,利用MISA软件检测出20 666个SSR位点,分布于13 849条Unigene中,出现频率为28.29%,平均分布距离为2.51 kb。优势重复基序为三核苷酸、四核苷酸,分别占总SSR位点的50.16%和20.94%。ATG/ATG和AAAC/GTTT分别是三核苷酸、四核苷酸的优势重复基元,占总SSR...
利用16对SSR和10对SCoT引物对99个菊花品种的基因组变异进行扫描,分析其群体结构,并采用一般线性模型GLM和混合线性模型MLM方法对10个表型性状进行关联分析。供试群体Shannon’s 指数为 1.46 ~ 2.52。群体遗传结构分析将99个菊品种划分为5个亚群。GLM分析发现有8个SSR位点与7个表型性状相关联(P < 0.01),其中与3个花部性状(花序直径、花序高度、舌花宽度)相关...
以中国古老月季品种‘月月粉’(Rosa chinensis‘Old Blush’,用OB表示)为母本,‘无刺光叶蔷薇’(Rosa wichuriana‘Basye’s Thornless’,用W表示)为父本,构建F1代共296个单株。从146对SSR标记中筛选出亲本间多态性好且条带清晰的23对SSR标记,对随机选择的94株F1进行杂种鉴定和遗传分析。结果表明:筛选到3个纯合显性标记分别为Fv512...
南方红豆杉转录组SSR挖掘及分子标记的研究
红豆杉 转录本 引物 SSR
2014/6/13
利用Trinity软件对NCBI公共数据库中公布的南方红豆杉(Taxus chinensis var. mairei)根、茎和叶的转录数据进行转录组的重新拼接。通过对13 737 528条序列组装得到96 279条Unigenes(38 Mb),通过SSR检测程序从96 279条Unigenes中得到2 160个SSR位点(2.24%),其平均发生率为1/18.01 kb,基序长度为14 ~ 25...
龙牙百合DNA 的提取及I SSR- PCR 体系的建立
龙牙百合 DNA 提取 ISSR- PCR
2009/6/26
[ 目的] 研究龙牙百合总DNA 的提取方法, 建立优化的ISSR-PCR 反应体系和程序, 为种质资源研究奠定基础。[ 方法] 利用改良
的CTAB 法提取龙牙百合基因组DNA, 并对影响ISSR 扩增反应的各因素进行优化。[ 结果] 获得了高质量的龙牙百合基因组DNA; 优化
的龙牙百合ISSR-PCR 反应体系为,25 μl 体系中含60 ng 模板DNA,0 .4 μmol/ L I...
基于EST信息的百合SSR标记的建立
百合 EST SSR 引物设计
2009/2/10
依据已知的百合EST(expressed sequence tags)序列信息,开发新的SSR(simple sequence repeats)标记,在NCBI的EST数据库1 688 EST中检索到98条含有101个SSR的序列, SSR的检出率为5.98%,其中三核苷酸重复类型占主导地位,出现频率为2.84%。EST-SSR的重复基元共搜索到47种,其中三核苷酸重复基元类型最为丰富,大约占重复...