搜索结果: 1-15 共查到“果树学 SSR”相关记录18条 . 查询时间(0.153 秒)
近日，从国家知识产权局获悉武汉植物园的发明专利“一种用于苹果果实糖含量表型筛选的SSR分子标记及其应用”（ZL 201910499464.4）获国家发明专利授权。发明人：韩月彭，彭倩，马百全。将分子遗传手段应用于农作物育种具有广阔的发展前景，然而由于缺乏高精度的基因组参考信息，重要农艺性状的基因定位难以应用于生产实践。随着现代基因组学的飞跃发展，涌现了一批高质量基因组序列和注释信息，搭建了基于全基...
选取海南大学油梨种质资源圃的‘Fuerte’油梨花朵和小果进行转录组测序，获得18 010条序列，总长度为29 422 056 bp。利用MISA软件检索转录组测序数据，获得分布于4 687个序列中的6 312个SSR位点。经统计发现，SSR在所检测的序列中出现的频率为35.05%。分析SSR位点特征显示，所有类型的SSR平均长度为18.90 bp，SSR之间的平均距离为4.66 kb。‘Fuer...
采用荧光SSR分子标记对来源于中国9个省的苹果属山荆子8个种群和楸子9个种群共288份种质的遗传多样性和种群遗传结构进行了研究。结果显示：19对SSR引物对288份种质共扩增出416个多态性等位基因，平均每个位点等位基因21.895个，多态性位点百分率（PPB）为100%。山荆子和楸子共计17个种群总体的遗传多样性较高，有效等位基因数（Ne）为9.284，平均期望杂合度（He）为0.862，Sha...
龙眼EST-SSR标记开发及无患子科5个属种质遗传多样性分析
无患子科 龙眼 SSR 转录组
2019/8/6
基于龙眼品种‘香脆’果实的转录组测序数据库，开发龙眼EST-SSR引物，评价其在无患子、红毛丹、荔枝、龙荔等4个近缘属植物上的通用性，并进行无患子科5个属55份种质的遗传多样性分析。在13 934条龙眼Unigene中搜索到SSR位点6 683个，SSR发生频率为47.96%，平均分布距离为4.48 kb；单、二和三核苷酸重复是主要的SSR类型，分别占52.78%、26.25%和20.19%；设计...
杨梅基因组SSR引物的开发与应用
杨梅 基因组 SSR
2019/3/5
基于杨梅（Myrica rubar Sieb. et Zucc.）基因组序列信息，研究了1 431条scaffold中SSR位点的分布特点。共发掘到二至六核苷酸SSR位点43 842个，分布在623条scaffold中，共有194种重复单元。二核苷酸SSR位点有36 383个，占总SSR的82.99%；AG/CT的出现频率最高，为55.70%，占总SSR位点的46.23%。三核苷酸SSR位点有6 ...
对高丛越橘品种‘布里吉塔’叶片转录组序列进行了简单重复序列（SSR）位点搜索和分析，发现了22 058个SSR位点，总发生频率为21.32%。SSR重复类型以二核苷酸发生频率最高（77.70%），三核苷酸次之（21.45%）。选用53对SSR引物在8个越橘属植物中进行PCR扩增，筛选出15对条带清晰且能稳定扩增的SSR核心引物。使用核心引物对39份越橘属种质进行分析，有效等位基因数最大值为7.11...
莲雾转录组SSR信息分析及其分子标记开发
莲雾 转录组 SSR 多态性
2018/3/27
对莲雾[Syzygium samarangense（Bl.）Merr. et Perry]开展转录组测序分析，共获得87 538条Unigene。利用MISA软件搜索1 kb以上的21 153条Unigene，共检测出11 641个SSR位点，分布于8 115条Unigene中，出现频率为55.03%，平均分布距离为4.08 kb。优势重复基序为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸，分别占总SSR的43....
黄皮转录组SSR挖掘及其可用性分析
黄皮 转录组 SSR 可用性分析
2018/4/3
利用MISA软件筛选黄皮（Clausena lansium）转录组测序获得的68 998条Unigene，共检测出单核苷酸至六核苷酸重复类型的SSR位点11 825个，分布于11 000条Unigene中，出现频率为17.14%，平均分布距离为4.41 kb。6种SSR位点类型中主要为单、二、三个核苷酸重复，分别占总SSR位点的41.48%、24.92%和27.53%。11 825个SSR位点中共...
对平欧杂交榛的转录组数据进行了深入挖掘，以期开发其SSRs标记。在25 649条含SSR序列的Unigene中，共找到35 604条SSR序列；其中，单、二、三核苷酸重复为高频类型，其数量及所占百分比分别为：10 102（28.37%）、16 543（46.46%）、7 035（19.76%）；在单核苷酸重复中，A/T重复最多（28.13%）；二核苷酸重复中，AG/CT（35.79%）、AT/AT...
基于EST-SSR标记的贵州野生刺梨居群遗传多样性分析
刺梨 SSR 遗传多样性 居群遗传结构
2017/11/24
通过分析评价贵州野生刺梨（Rosa roxburghii Tratt）资源居群遗传多样性和遗传结构，为刺梨资源的保护和发掘利用提供科学依据。【方法】从刺梨EST-SSR引物中筛选扩增效果好、多态性较高的10对引物，对收集的12个野生刺梨自然居群（共255份资源）的遗传多样性及遗传结构应用POPGENE 1.31软件进行分析,并根据Nei’s标准遗传距离，利用NTSYS-pc2.10e软件对各居群进...
采用10对EST-SSR引物和9个果实品质性状指标对收集的220份野生刺梨（Rosa roxburghii Tratt）资源的遗传多样性进行分析，结果表明：10对EST-SSR引物共扩增出多态性条带27条，多态百分率为76.67%；9个品质性状中平均单果质量、可滴定酸、固酸比、维生素C和类黄酮含量的变异系数达到20%以上；说明该220份贵州野生刺梨种质资源遗传变异丰富，遗传多样性分布范围较广，适于...
新疆野扁桃TP-M13-SSR的引物开发研究
毛细管电泳荧光检测 多态性 全基因组重测序
2017/11/13
该试验自主设计新疆野扁桃TP-M13-SSR引物，从中筛选多态性最佳的引物以供后续研究使用。从该植物的5个居群中分别挑选2份叶片提取基因组DNA，扩增后的产物使用毛细管电泳荧光检测并分析。经分析可得出12对新疆野扁桃TP-M13-SSR引物的期望杂合值(He)、观测杂合值(Ho)、等位基因数目(Na)、香农指数(I)、固定指数(F)、多态性信息含量指数(PIC)的范围分别为0.656~0.859、...
野生毛花猕猴桃叶片和果实AsA 含量的SSR 标记关联分析
毛花猕猴桃 抗坏血酸 群体结构分析 关联分析
2014/6/12
以抗坏血酸（AsA）含量变异丰富的野生毛花猕猴桃（Actinidia eriantha Benth.）种群为试
验材料，对其叶片和果实中的AsA 含量与SSR 标记进行关联分析。结果表明：通过SSR 分子标记技术和
群体结构分析，可将70 份野生毛花猕猴桃种质材料分为4 个亚群；GLM 模型分析结果显示，在P < 0.01
水平上检测有7 个SSR 标记与叶片和果实AsA 含量紧密相关，各标...
柑橘10 个品种实生后代多倍体的发掘及SSR 鉴定
柑橘 多倍体 SSR分子标记
2014/4/9
秋季采摘柑橘成熟果实并剥取种子，将小粒种籽和瘪籽播于MT 培养基，待萌发长出2 ~ 3片真叶时，取其叶片检测倍性；将饱满种籽播种于露地，对其幼苗首先通过形态筛选获得似多倍体的植株，然后取其叶片用流式细胞仪进行倍性检测；最后对获得的多倍体植株进行SSR 分子鉴定。试验结果表明，获得早金甜橙、卡特夏橙、塔罗科血橙、日辉橘、Ortanique 橘橙、默科特橘橙、华农本地早橘、朱红橘和Flame 葡萄柚等...
