搜索结果: 76-90 共查到“知识库 作物遗传学”相关记录4993条 . 查询时间(0.953 秒)
水稻分蘖期氮素应答的转录组动态分析
水稻 氮素 转录组 分蘖期
2021/3/31
氮素是水稻生长发育必需的大量营养元素,通过探索水稻分蘖期对氮的转录响应,筛选氮素应答基因用于培育氮素利用率高的水稻品种,同时为水稻的精准栽培提供转录组学指导。以五优稻4号为材料,于施氮后7,14,21 d分别收获了五优稻4号叶片,并进行动态转录组分析。氮素处理使分蘖期水稻叶片颜色加深,并检测到3 870个差异表达基因(DEGs)。GO分析显示,这些基因主要参与了代谢过程、细胞过程、细胞组分、催化活...
为探讨春季低温(倒春寒)胁迫下抗倒春寒能力不同的小麦品种相关miRNA及其响应规律,提供miRNA的表达谱和差异表达miRNA的信息,揭示差异表达miRNA在小麦抗倒春寒中的作用,采用高通量测序(Small RNA-seq)技术对雌雄蕊原基分化期0℃低温胁迫72 h及未低温处理(对照)的矮抗58(AK58)和郑麦366(ZM366)幼穗进行测序,通过生物信息学分析,以padj<0.05且|log2...
丹参DHAR家族基因的鉴定及表达模式分析
丹参 抗性 基因家族 生物信息学
2020/12/11
运用生物信息学方法,从丹参(Salvia miltiorrhiza)基因组数据库中鉴定得到5个脱氢抗坏血酸还原酶(Dehydroascorbate reductase,DHAR)家族成员SmDHAR1 ~ SmDHAR5,分析了基因结构特征、编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、高级结构、系统进化关系以及启动子顺式作用元件,并考察了其在不同组织及胁迫下的表达模式。结果表明,SmDHAR基因家族成员长度在...
为揭示栽培种花生含油量遗传机制,以高产抗逆品种花育36号和高油品系6-13为亲本,构建了181个重组自交系(RIL,Recombinant inbred line),以F2:7-F2:8重组自交系为试验材料,测定在3个环境下(E1、E2、E3)的籽仁含油量,进行QTL定位和上位效应分析。结果表明,群体含油量存在超亲遗传,且符合正态分布,广义遗传率为0.55。基于复合区间作图模型共检测到5个QTL,...
为了从转录本水平阐明水分胁迫下的枣裂果的分子机制,以5 a生金丝新4号品种为试验材料进行50 h的喷淋,模拟水分胁迫,处理结束后对喷淋前后的样品在ONT平台进行3代全长转录组测序。6个样品共获得13 368条转录本序列,APA事件中鉴定到9 178个PolyA位点,并找到78个显著富集的PolyA信号(PAS)motif,预测到7 321个SSR和114个lncRNA;对照组和处理组分别鉴定到23...
山西农业大学农学院团队:龙城校区小麦遗传与分子育种山西省科技创新重点团队
龙城校区 小麦遗传 分子育种
2023/5/22
小麦遗传与分子育种山西省科技创新重点团队于2013年创建,2016年被定为重点创新团队。本团队紧紧围绕小麦学科发展趋势和小麦产业的需求,针对拓宽育种遗传基础与高效创造新种质研究中的关键科学问题,系统开展小麦遗传育种领域的种质创新、技术创新、品种创新和理论创新工作,加快育种新技术的应用,加速新品种转化为现实生产力。
为了研究马铃薯WRKY57基因(PGSC transcript number PGSC0003DMT400072958)功能,通过RT-PCR克隆得到马铃薯耐旱品种PB06的StWRKY57基因cDNA序列,命名为StWRKY57-PB。利用生物信息学方法对其序列特征进行了分析;以pGEX-KG为基本骨架,构建了StWRKY57-PB蛋白的原核表达载体并在大肠杆菌中进行了表达和纯化分析。结果表明,...
森林草莓6mA甲基转移酶基因鉴定及功能分析
森林草莓 N6–腺嘌呤甲基化(6mA) N6–腺嘌呤甲基转移酶 系统进化 逆境胁迫
2020/12/11
通过生物信息学手段,鉴定出森林草莓(Fragaria vesca)基因组中两类可能的6mA甲基转移酶基因5个(3个MT-A70、2个DAMT基因)。对细菌、真菌、动物和植物中的6mA甲基转移酶基因的系统进化分析及染色体定位表明,森林草莓MT-A70基因可分为3个亚家族,且在动、植物分化前就已经存在:两个DAMT基因由物种特异的串联重复产生,且结构变化快,推测其在进化历程中功能发生了分化。转录组数据...
为探究乙酰转移酶基因对甘蓝型油菜脂肪酸代谢的影响,以低亚麻酸油菜20~35 d自交种cDNA为模板,克隆了乙酰转移酶基因(Acetyltransferase gene,AT)的2个拷贝(114和148),并进行生物信息学分析以及构建了过表达载体和干扰载体,并转化拟南芥,经潮霉素筛选T0种子,PCR鉴定抗性苗后,收获T1种子,用气相色谱法检测T1种子脂肪酸组成。结果显示,114编码的蛋白偏中性而14...
为了研究甘蓝型油菜在铝胁迫条件下内参基因的稳定性,在受到主要铝毒害的根组织内发掘新内参基因,以甘蓝型油菜耐铝品种赣油杂7号和铝敏感品种蓉油18的苗期根组织为研究材料,对营养液培养的试验材料分别设置对照组(0 h)和2个时间梯度(3,24 h)的铝胁迫(100 μmol/L AlCl3,pH值4.5)处理组。首先,采用有参考基因组的转录组测序技术(RNA-seq)及FPKM值差异基因表达分析,筛选出...
内蒙古平原灌区“春麦冬播”种植效应及品种适应性
春麦冬播 品种 产量 内蒙古平原灌区
2021/1/28
针对内蒙古春播小麦生育期短、干热风、高温逼熟等因素制约产量提高, 且收获后光温资源极大浪费的现状, 以及试种冬小麦发现的冬季冻害、春季干旱或“倒春寒”影响返青率及前茬限制等问题, 本研究以“春麦冬播”种植模式为切入点, 采用不同春化类型小麦品种, 通过连续2年的田间试验, 系统研究了不同小麦品种越冬出苗、叶片生理、根系性状及产量形成的差异, 以期筛选适宜冬播的小麦品种。结果表明: 供试的全部春性小...
甘蓝型油菜耐盐和耐旱相关性状的QTL分析
甘蓝型油菜 耐盐性 耐旱性 数量性状位点
2021/1/28
盐胁迫和干旱胁迫是非生物胁迫中影响作物产量的重要因素, 检测与耐盐和耐旱相关的QTL, 可为抗逆油菜品种的选育提供理论依据。本研究利用德国冬性甘蓝型油菜Express和中国半冬性甘蓝型油菜SWU07为亲本构建的包含261个株系的双单倍体(doubled haploid, DH)群体, 分别以1.2% NaCl溶液和20% PEG-6000溶液作为培养液模拟盐胁迫和干旱胁迫, 去离子水为对照, 对2...
粒型、株高及穗部组成性状与产量形成密切相关, 是水稻重要农艺性状, 但遗传基础复杂。染色体片段代换系是用于复杂性状遗传研究的良好材料。本研究鉴定了一个以日本晴为受体、西恢18为供体亲本的水稻优良染色体片段代换系Z746。Z746携带来自西恢18的7个代换片段, 平均代换长度为3.99 Mb, 其株高、粒长和穗部性状均与受体存在显著差异。进一步通过日本晴与Z746杂交构建的次级F2群体共检测到36个...
干旱是导致全世界棉花严重减产、纤维品质下降的重要因素, 因此获得高产、优质、耐旱的棉花新品种一直是棉花的育种目标。本研究选取217份陆地棉栽培种组成的自然群体为研究对象, 采用全生育期处理组灌水量为对照组50%的干旱胁迫处理, 并在处理后期对217份材料的株高、衣分、单铃重等18个性状进行2年2点的表型鉴定, 干旱胁迫后, 群体间响应差异明显, 多个表型性状在对照和处理间表现显著差异。通过BLUP...
棉花CRISPR/Cas9基因编辑有效sgRNA高效筛选体系的研究
棉花 瞬时转化 CRISPR/Cas9 基因组编辑
2021/1/28
单向导RNA (sgRNA)是CRISPR/Cas9基因组编辑技术体系的重要元件之一。然而研究显示, 很多sgRNA不能有效工作, 因此需要对多个设计的候选sgRNA进行筛选, 以验证它们的有效性。早期对sgRNA有效性的验证采用的是完整编辑载体瞬时转化原生质体或者叶片的方法。这些方法费时费力, 成功率不高, 尤其是对于原生质体制备效率比较低的棉花。本研究针对GhMAPKKK2和GhAE基因分别设...