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基因调控网络(Gene Regulatory Network, GRN)以网络形式展示了生物系统中基因之间的调控机制,为理解分子间相互作用和生物过程提供了重要线索,并与生物体发育、环境适应,疾病表型等密切相关。转录因子和目标基因之间的调控关系是一种天然的因果关系。面向转录组数据推断基因调控网络一直以来都是大家关心的科学问题,与基于广义相关性的方法相比,基于因果关系的方法推断基因之间的调控关系似乎更...
白粉病是葫芦科作物的三大主要病害之一。设施栽培中的高温高湿环境很容易诱导白粉病的爆发,严重影响黄瓜产量和品质。目前,黄瓜白粉病的防治主要依赖化学药剂,然而在一个生长季内需多次施药,对以鲜食为主的黄瓜而言,因农药残留导致的食品安全隐患不容小觑。黄瓜白粉病抗性是由多基因位点控制的数量性状,传统育种技术很难高效整合多个抗病基因而不引入连锁累赘。利用CRISPR/Cas多基因编辑技术同时敲除多个隐性抗病基...
2024年1月24日,万建民院士领衔的南京农业大学和中国农业科学院作物科学研究所的科研团队合作在国际著名期刊The plant cell在线发表了题为“Rice LIKE EARLY STARVATION1 cooperates with FLOURY ENDOSPERM6 to modulate starch biosynthesis and endosperm development ”的研究...
2024年2月22日,由中国工程院院士、中国科学院亚热带农业生态研究所研究员印遇龙领衔的科研团队,在仔猪肌肉生长阻滞发生机制研究方面取得进展。在集约化养殖过程中,免疫应激普遍存在于断奶仔猪饲养环节,导致仔猪肌肉蛋白质降解和生长阻滞,影响肥育阶段的产肉率和肉品质,给养猪业带来经济损失。因此,有效缓解仔猪免疫应激是当前养猪生产亟待解决的难题。然而,目前对免疫应激仔猪肌肉蛋白质降解和生长阻滞的发生机制知...
青藏高原是中国最大、世界海拔最高的高原,素有“世界屋脊”、“第三极”之称。青藏高原独特的地形特征使其成为众多河流的主要源头,并作为“水塔”滋养着周边地区近20亿人。青藏高原的水生态系统类型多样,包括湿地、湖泊、河流、温泉和冰川等,孕育着丰富多样的水生微生物。这些微生物可能在青藏高原极端的环境条件下,如剧烈的温度波动、低氧浓度、低压和强烈的紫外线辐射,展现出独特的种类组成和代谢模式,使得青藏高原可能...
性二态(亦称“第二性征”)是雌雄异体的生物个体在繁殖器官以外的形态、生理和生活史等方面所呈现的差异化特征。性二态通常源于性别偏向基因的差异表达。相关工作始于模式动物果蝇的性别偏向基因鉴定和演化特征分析。研究发现,在正选择和放松的纯化选择作用下,雄性偏向基因显示出较快的蛋白质序列演化速率。由于多数高等植物均为雌雄同株,即使在雌雄异株的植物中第二性征的发育通常不明显,鲜有关于植物性别偏向基因的报道。
单细胞技术的广泛应用产生了大量的单细胞数据,因此对单细胞数据分析和解释方法的需求不断增长。虽然单细胞数据可以通过机器学习等方法进行分析,但对数据的解释仍相对缺乏。基因组规模代谢模型(Genome-scale metabolic model,GEM)包含先验的代谢网络知识,已成为整合并解释批量样本组学数据的强大工具。因此,GEM或许也能用来分析和解释单细胞数据,而该领域也确实正在兴起。利用GEM&#...
微生物总是生活在不断变化的环境中。为了生存,细菌建立了适应这些变化的能力。其中,代谢通量的重排和蛋白质组的重分配是细菌应对环境变化的常用策略[1-2]。比如,当外部营养条件改变时,细胞会及时调整内部代谢活动以合成氨基酸前体等关键代谢物,进而引起蛋白质组中不同种类蛋白质(例如转运蛋白、核糖体蛋白和代谢酶)的合成速率。我们知道,细胞内的化学反应绝大多数属于酶促反应。因此,蛋白质组中各蛋白组分的重分配反...
基因组重排是驱动生物进化的重要力量,也是导致多种疾病如癌症等复杂性疾病的关键因素。基因组重排包括缺失、重复、插入、倒位和易位等多种形式,可通过改变基因拷贝数、扰动蛋白质编码序列以及顺式调控网络来实现。前人研究表明,基因组重排普遍存在于从原核生物到人类的所有生命系统中,同时相较于碱基突变而言,基因组重排导致物种进化的速度高出好几个数量级。SCRaMbLE系统的植入是酵母基因组合成计划(Sc2.0)中...
花序分枝数量决定果实数目和大小,是决定番茄品种优劣的重要指标。高温影响番茄花序形态的建成,但高温是如何传递信号并影响花和花序分枝形成的研究仍然有限。2024年2月20日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所品质分子改良课题组研究鉴定了数量性状基因座qMULTIPLE INFORESSENCE BRANCH 2(qMIB2),它调节番茄(Solanum lycopersicum)的花序分枝以响应高环境温度。...
西安交大一附院肝胆外科吕毅教授和张谞丰教授团队首次揭示Y染色体及其编码基因是导致男性相较于女性肝纤维化发病率更高、进展更快的关键遗传因素,相关成果近日发表在《肝脏病学杂志》上。
2024年2月18日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜分子设计育种创新团队程锋研究员联合马铃薯遗传育种与栽培创新团队李广存研究员,基于深入解析异交(异花授粉)物种或长世代物种的F1分离群体的遗传特点,开发了一套专用的BSA 新算法工具OcBSA,以高效促进其基因挖掘,从而推进该类物种的分子育种。研究成果以“OcBSA: an NGS-based Bulk Segregant Analysis To...
2024年2月9日,中国科学院城市环境研究所对幼儿园室外降尘中的抗性组和病原菌进行了研究,并取得了重要进展。该研究强调了关注由抗生素耐药基因(ARGs)和病原菌共同引发的健康威胁的重要性,对保障儿童的健康成长具有指导意义。
植物遗传转化技术是植物基因工程和现代农业分子育种的必要工具。然而,现有的植物遗传转化方案复杂且效率较低,制约了多数资源植物或农作物的遗传改造,已成为植物资源开发和利用的技术障碍。因此,开发高效且多应用的植物遗传转化技术成为植物或农业科研领域的重要研究方向。
L-苹果酸是一种重要的天然有机酸,广泛用于食品、饮料、饲料、医药保健、化工、材料等行业;用于反刍动物饲料添加剂,可显著降低甲烷排放和增强料肉比;其工业市场容量超过100万吨/年,市场前景广阔。而生物质为碳中性原料,具有廉价可再生等特点,利用合成生物技术,构建以秸秆为原料,直接一步发酵合成大宗化学品的整合生物炼制技术,将有效地降低目标产品的生产成本,为将来绿色生物制造提供新路径。

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