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近日，西北农林科技大学动物医学院家畜胚胎工程研究团队苏建民教授课题组联合西宁市动物疫病预防控制中心在自然指数（Nature index）期刊《 Journal of Biological Chemistry 》杂志发表题为“Single-cell RNA-seq and single-cell bisulfate-sequencing reveal insights into yak pre-im...
中国科学院动物研究所合作揭示调控灵长类器官衰老的表观转录组机制（图）
器官衰老 表观转录 真核细胞 胚胎发育
2023/6/13
m6A是目前已知的真核细胞mRNA上最为常见的一类化学修饰，它的建立、读取和擦除分别受到相应甲基化酶（writer）、结合蛋白（reader）以及去甲基化酶（eraser）的动态可逆调控。研究表明，m6A能够通过调节mRNA的剪接、出核、稳定性以及翻译等生命周期活动，参与调控机体的诸多生理或病理进程，包括胚胎发育、肿瘤以及神经退行性疾病的发生等。然而，在生理性衰老过程中，m6A对于器官稳态维持的调...
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所肉羊遗传育种团队研究发现转录因子TFDP1通过上调RBP4的转录表达促进山羊颗粒细胞增殖（图）
肉羊遗传育种 转录因子TFDP1 山羊颗粒细胞增殖
2022/10/17
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所肉羊遗传育种科技创新团队在山羊多羔性状分子调控机制研究方面取得新进展，为解析山羊多羔性状分子机制及颗粒细胞增殖提供了新见解。相关研究成果发表在《细胞（Cells）》上。
旨在比较胚胎期和成年期双峰驼瘤胃在组织形态、编码基因表达上的变化，挖掘影响双峰驼瘤胃发育的关键基因和通路，从消化系统探究双峰驼的沙漠适应性机制。本研究选取3峰10~12岁健康状况良好的成年期阿拉善双峰驼，以及3峰9~10月龄健康状况良好的胚胎期阿拉善双峰驼，采集瘤胃组织样品，制作石蜡组织切片，观察成年期与胚胎期双峰驼瘤胃，比较其组织结构之间的差异。分别提取成年期和胚胎期双峰驼的瘤胃组织总RNA，利...
旨在分析禽腺病毒血清4型（FAdV-4）感染鸡组织中NLRP3基因的转录水平，本研究设计鸡NLRP3特异性引物，利用RT-PCR扩增NLRP3基因180 bp片段并克隆至pMD-18T载体，制备重组质粒pMD-18T-NLRP3。以pMD-18T-NLRP3质粒作为标准品进行荧光定量PCR并建立标准曲线。通过反应条件优化，成功建立了检测NLRP3基因的实时荧光定量PCR方法，并利用该方法对致病性F...
旨在探究大熊猫粪便中微生物组成以及耐药基因和寄生虫的真实情况。采集6只健康成年大熊猫的新鲜粪便，利用宏转录组学测序技术分析大熊猫粪便微生物组成及功能、耐药基因种类、丰度和寄生虫的组成，探讨优势细菌与耐药基因的相关性。结果表明，大熊猫粪便内微生物种类多样，包括细菌、真菌和病毒等，但以细菌为主。在门水平上，细菌类群中厚壁菌门（Firmicutes）和变形菌门（Proteobacteria）为优势菌门，...
外源注射miR-499-5p对肉鸡腓肠肌转录组的影响
肉鸡 肌纤维直径 转录组测序 肌肉发育
2021/3/11
旨在探讨外源注射miR-499-5p对肉鸡腓肠肌肌纤维直径及基因表达的影响，完善miR-499-5p对肉鸡骨骼肌发育的分子调控机制。本研究选用14日龄健康大恒肉鸡公鸡16只，随机分为2组，每组8个重复，均正常饲喂日粮，分别在腓肠肌部位肌肉注射agomiR-NC（对照组，5 nmol）和agomiR-miR-499-5p（注射组，5 nmol），为保证试验效果，每3 d注射1次，共注射6次。注射完成...
牛体内囊胚全转录组模式解析
牛体内囊胚 mRNA lncRNA circRNA
2020/7/10
旨在解析牛体内囊胚的全转录组模式。本研究选择3头15月龄以上、健康状况良好的泌乳奶牛，采用超排获得体内囊胚，采用单细胞全转录组测序技术检测囊胚mRNA、lncRNA、circRNA转录模式，并采用生物信息学工具对其进行分析。试验获得牛体内囊胚约19 975个mRNAs、12 715个novel lncRNAs及887个circRNAs。mRNA有12种可变剪切方法，以转录起始区域可变剪切（TSS）...
为探明藏黄牛对低氧适应的相关差异表达基因并分析差异表达基因功能和代谢通路，以藏黄牛和三江黄牛心脏组织为研究对象，提取总RNA，建立测序文库后利用Illumina HiSeqTM 4000进行测序，经生物信息学分析筛选出差异表达转录本，并对差异表达基因进行GO富集和KEGG通路分析，最后采用荧光定量PCR（RT-qPCR）验证测序数据的准确性。结果表明：藏黄牛相比于三江黄牛得到显著差异表达基因608...
转录组揭示禁水环境下双峰驼结肠组织适应机制
双峰驼 结肠 转录组 水代谢
2019/1/17
旨在了解骆驼属在缺水条件下组织环境适应机制。本研究选取6峰6~9岁的成年阿拉善双峰驼，随机分为2组，第一组为对照组（colon1_3），正常采食饲料与水；第二组为禁水组（colon3），不给骆驼饮水，其他处理（饲草量）与对照组相同，禁水24 d。采用Illumina HiSeq 2000测序平台通过对禁水（试验组）与正常饮水（对照组）条件下双峰驼结肠组织进行转录组测序，并对转录组数据进行质控、比对...
猪MITF-M的转录调控分析
猪 MITF-M 转录活性 KLF4
2019/1/17
旨在研究猪MITF-M（microphthalmia associated transcription factor M）转录调控区域活性以及验证重要转录因子。以猪DNA为模板，利用PCR扩增获得MITF-M转录调控区，基因克隆得到5'端缺失重组载体，运用双荧光素酶报告基因试验进行转录活性分析，再通过干扰RNA试验验证重要转录因子。本试验成功克隆得到MITF-M 6 414 bp的转录调控区域；构...
促肾上腺皮质激素对母猪肝中葡萄糖代谢相关酶转录表达及活性的影响
ACTH 肝 糖代谢 母猪
2019/1/17
旨在研究促肾上腺皮质激素（adrenocorticotropic hormone，ACTH）对母猪肝中葡萄糖代谢相关酶转录表达及活性的影响，以探讨应激状态下肝调节血糖水平的分子机制。本研究选取9头健康经产断奶苏淮母猪，随机分成处理组（5头）和对照组（4头）。对处理组母猪注射外源ACTH，对照组母猪注射生理盐水；每天处理3次，连续7 d。试验期间每天采集母猪血液；试验结束后，取母猪肝组织。利用放射免...
F18大肠杆菌抗性型与敏感型苏太断奶仔猪十二指肠组织比较转录组分析
猪 F18大肠杆菌 抗性基因 调控通路
2019/1/16
旨在揭示培育品种-苏太猪（杜洛克×梅山猪）F18大肠杆菌抗性的调控通路和重要候选基因，同时进一步探究中外猪品种F18大肠杆菌抗性调控遗传基础的差异。本研究以课题组前期获得的苏太猪和梅山猪F18大肠杆菌抗性型与敏感型断奶仔猪全同胞个体为研究对象，通过转录组测序筛选苏太猪F18大肠杆菌抗性相关的调控通路以及重要候选基因，并在细胞水平，利用qPCR和Western blot分析F18大肠杆菌刺激小肠上皮...
胚胎附植是影响母猪产仔数的一个重要因素，本研究旨在找到猪胚胎附植的关键调控基因。选用5～7胎次梅山猪母猪4头，在其妊娠第18和24天分别屠宰2头，采集其卵巢组织进行转录组测序（RNA-seq）分析，GO功能富集分析及Pathway分析。结果表明：1）猪胚胎附植中期卵巢（卵_18 d）和后期卵巢（卵_24 d）两个组织样检测到的表达基因中最多的序列（reads）均为外显子序列；卵_18 d测得rea...