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中国科学院昆明动物研究所石磊课题组合作研究揭示DNA甲基化在树鼩大脑二态性进化方面的贡献(图)
石磊 进化 基因 遗传
2024/12/2
树鼩是一种广泛分布于中国和东南亚的小型哺乳动物,因其高脑重比,被认为是最接近灵长类动物的哺乳动物,适于作为新的模式物种在神经科学领域进行研究。表观调控关键因素DNA甲基化在基因表达、X染色体失活等调控过程中均发挥重要作用,但目前利用树鼩开展DNA甲基化表观遗传机制方面的研究还较少,因此研究树鼩大脑的DNA甲基化模式有助于进一步理解表观调控在灵长类大脑进化中的作用,同时提高树鼩作为模式物种的实用性。
中国科学院动物所等开发出低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术(图)
动物 基因 检测
2024/7/18
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究。其中,PacBio高保真测序技术因高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而,PacBio标准建库方法需要大量DNA输入,限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用。DNA扩增虽然可以降低样本输入量,但会引入扩增偏好和人工嵌合序列等错误,影响基因组的完整性以及变异检测的准确性。因此,亟待开发低DNA用量、...
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。随着价格的下降,基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究(Nat Methods 2022;Nat Rev Gene 2024);其中,PacBio高保真(High-fidelity,HiFi)测序技术因其高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而,其标准建库方法需要大量DNA输入(>1 μg),限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用(Pro...
2024年7月4日,国际学术期刊Nature Methods在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)陈玲玲研究组关于CRISPR-dCas12a应用于DNA活细胞标记的最新研究进展:“CRISPR array-mediated imaging of non-repetitive and multiplex genomic loci in living cells”...
提速2倍!DNA比对新算法研发成功(图)
DNA比对 新算法 研发成功
2024/8/23
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队提出DNA比对新算法,并研发出DNA比对软件“BSAlign”。相比同类并行算法,新算法能够更快生成最优比对结果,且准确度更高。相关研究成果发表在《基因组蛋白质组与生物信息学报(Genomics, Proteomics & Bioinformatics)》上。
国家自然科学基金委员会中国学者在DNA转座子多样性研究和基因工程技术开发方面取得进展(图)
基因工程 细胞 遗传 元件
2024/8/25
在国家自然科学基金项目(批准号:32325014)等资助下,中国科学院动物研究所张勇课题组与王皓毅课题组开展合作研究,在DNA转座子多样性研究和基因工程技术开发方面取得进展。研究成果以“人源细胞130个DNA转座子的异源性调查揭示其功能多样性并扩展基因工程技术工具箱(Heterologous survey of 130 DNA transposons in human cells highligh...
自1948年Barbara McClintock首次报道转座子以来1,这类跳跃遗传元件对宿主演化的重要意义逐渐被揭示2-5。其中,DNA转座子作为主要类型之一,长期以来备受关注。然而,由于以往多为个案研究,DNA转座子活性的决定因素与进化模式的一般规律尚不清晰。不仅如此,尽管DNA转座子可作为基因工程工具用于插入诱变或转基因载体6,7,但目前只有Sleeping Beauty(SB)等少数几种转座...
中国水产科学研究院珠江所对鱼类DNA 条形码数据库的开发取得进展(图)
数据 基因 种质资源
2024/6/8
2024年6月5日,珠江水产研究所观赏渔业研究室在国际学术期刊《Database》(JCR 1区,IF2022=5.8)在线发表“CoSFISH: a comprehensive reference database of COI and 18S rRNA barcodes for fish”的研究论文。该研究得到了中国-东盟海洋合作基金(CAMC-2018F)、2022年省级乡村振兴战略专项种业...