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华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室在改进细菌16S rRNA基因高通量测序方法研究上有新进展(图)
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室 细菌 16S rRNA 基因高通量测序 微生物组
2020/6/5
近日,华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室谢卡斌课题组在Microbiome发表了题为“Engineering CRISPR/Cas9 to mitigate abundant host contamination for 16S rRNA gene-based amplicon sequencing”的研究论文,论文报道了一种改进的细菌16S rRNA基因高通量测序方法。
应用16S rRNA基因V2高变区序列进行链霉菌分子分类
系统进化分析 链霉菌 16S rRNA基因
2009/9/10
用16S rRNA部分序列对Williams数值分类系统所包含的链霉菌属种或种群进行系统进化分析 。以包含16S rRNA 基因V2高变区在内的120 bp长核苷酸序列所作的系统进化树表明:这 些链霉菌可分为34个簇,其中大簇5个(包括27~85株菌株);中等大小簇3个(包括9~12 株菌);小簇8个(包括2~6株菌);单成员簇19个。结果同时表明,Williams数值分类系 统中根据形态、生理...
嗜盐古生菌AJ4中BR蛋白基因部分片段和16S rRNA基因序列研究
嗜盐古生菌 细菌视紫红质 16S rDNA 系统发育
2007/12/24
摘要 为了研究分析新疆阿尔金山国家自然保护区阿牙克库木湖嗜盐古生菌物种与细菌视紫红质(bacteriorhodopsin ,BR)蛋白资源 ,对分离纯化到的极端嗜盐古生菌AJ4 ,采用PCR方法扩增出其 16SrRNA基因 (16SrDNA)和编码螺旋C至螺旋G的BR蛋白基因片断 ,并测定了基因的核苷酸序列 .通过BR蛋白部分片段序列分析表明 ,BR蛋白中对于完成质子泵功能以及与视黄醛结合的关键性...