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中国科学院动物所等开发出低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术(图)
动物 基因 检测
2024/7/18
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究。其中,PacBio高保真测序技术因高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而,PacBio标准建库方法需要大量DNA输入,限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用。DNA扩增虽然可以降低样本输入量,但会引入扩增偏好和人工嵌合序列等错误,影响基因组的完整性以及变异检测的准确性。因此,亟待开发低DNA用量、...
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。随着价格的下降,基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究(Nat Methods 2022;Nat Rev Gene 2024);其中,PacBio高保真(High-fidelity,HiFi)测序技术因其高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而,其标准建库方法需要大量DNA输入(>1 μg),限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用(Pro...
2024年7月4日,国际学术期刊Nature Methods在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)陈玲玲研究组关于CRISPR-dCas12a应用于DNA活细胞标记的最新研究进展:“CRISPR array-mediated imaging of non-repetitive and multiplex genomic loci in living cells”...
天津工业生物所在细菌DNA多拷贝串联重复技术方面取得新进展(图)
细菌 代谢工程 基因
2024/6/18
细菌中构建DNA多拷贝串联重复用途十分广泛,在基因表达、代谢工程及基因组进化等研究中发挥重要作用。现有的DNA多拷贝串联重复技术分为体外和体内构建两种,体外构建通常存在耗时长、限制酶选择难、多聚体不稳定等问题,体内构建相对高效,但常用技术需事先在重复单元两端加上长同源臂,并依赖宿主自身的同源重组系统实现串联重复,且事后需破坏该内源重组系统来维持既得拷贝数的稳定性,对宿主产生潜在不利影响的同时操作依...
自1948年Barbara McClintock首次报道转座子以来1,这类跳跃遗传元件对宿主演化的重要意义逐渐被揭示2-5。其中,DNA转座子作为主要类型之一,长期以来备受关注。然而,由于以往多为个案研究,DNA转座子活性的决定因素与进化模式的一般规律尚不清晰。不仅如此,尽管DNA转座子可作为基因工程工具用于插入诱变或转基因载体6,7,但目前只有Sleeping Beauty(SB)等少数几种转座...
本发明涉及分子生物学技术领域,具体的说就是一种从广泛物种和土壤中提取基因组DNA的方法。现有的基因组DNA提取方法只适用于一个或几个物种,并且从土壤等特殊材料中提取DNA难以去除腐殖质﹑色素等污染物,影响基因组DNA质量。本发明设计的二氧化硅颗粒机械研磨和琼脂糖凝胶电泳相结合的DNA提取方法同时适用于从动物细胞﹑植物植物﹑微生物﹑土壤等广泛的材料中提取基因组DNA。该方法提取的基因组DNA质量高,...
中国水产科学研究院珠江所对鱼类DNA 条形码数据库的开发取得进展(图)
数据 基因 种质资源
2024/6/8
2024年6月5日,珠江水产研究所观赏渔业研究室在国际学术期刊《Database》(JCR 1区,IF2022=5.8)在线发表“CoSFISH: a comprehensive reference database of COI and 18S rRNA barcodes for fish”的研究论文。该研究得到了中国-东盟海洋合作基金(CAMC-2018F)、2022年省级乡村振兴战略专项种业...
II型DNA拓扑异构酶是一种普遍存在的酶,在调控双链DNA的拓扑结构中起着关键作用,参与了一系列最基本的DNA代谢过程,包括DNA复制、转录及重组等,并在原核和真核生物中得到了广泛的研究--它们被分类为IIA型(包括gyrase,topo IV和topo II)和IIB型(topo VI),虽然两类的结构不同,催化机制却是相似的--通过切割"G-segment"DNA,使"T-segment"DN...
中国科学院动物研究所专利:CXCL13 DNA疫苗及其应用
中国科学院动物研究所 专利 CXCL13 DNA疫苗
2024/5/31
中国科学院华南植物园关于植物DNA甲基化的调控研究获进展
植物 蛋白质 遗传
2024/6/2
DNA甲基化是表观遗传修饰的重要组成部分,可以通过改变染色质的结构、DNA的稳定性以及DNA和蛋白质的结合程度调控基因表达。在植物DNA甲基化的建立和维持过程中,植物特有的RNA聚合酶V(Pol V)通过转录出的非编码RNA招募一系列下游因子以实现对DNA的甲基化。目前,以Pol V为核心的DNA甲基化复合体已被鉴定出多个组分成员,但作为复合体核心Pol V的转录行为如何调控却不清楚。此外,鲜有关...